【2026年最新】健康管理システムおすすめ8選！人的資本経営に対応した選び方とメリット

2026年現在、企業の評価基準において、財務情報だけでなく「従業員が持続的に働ける環境か」といった非財務情報（人的資本データ）への注目が高まりつつあります。 特に上場企業や成長を目指す企業の間では、健康管理システムを単なる「健診結果の保存場所」としてだけでなく、「自社のホワイトな労働環境を示す『客観的数値（エビデンス）』の基盤」であり、成長のエンジンとして活用しようとする動きが見られます。

本記事では、こうした近年のトレンドを踏まえた健康管理システムの選び方、およびおすすめのシステム8選を徹底解説します。

健康管理システムの選び方と重要ポイント

人的資本経営の考え方が広まる中、システム選定においても「データの活用しやすさ」が重要な視点の一つになりつつあります。

自社のニーズを明確にする（将来的には開示も視野に）

システム導入の第一歩は、現状の課題解決に加え、将来的にどのようなデータを活用したいかを把握することです。

自社のニーズを明確にすることは、選定の第一歩です。2026年現在、上場企業における有価証券報告書への記載だけでなく、非上場企業においても「健康経営優良法人」の認定取得や採用力強化のために、データを活用・開示するケースが増えてきています。目指すゴールによって、集計すべきデータや必要な機能は異なります。

「ストレスチェックの集団分析結果」や「労働時間と健診結果の相関」など、どのような指標を可視化したいかを検討しましょう。次に、自社の従業員数を把握し、システムが対応できる規模を確認します。数千名規模の他社事例が多いシステムか、中小企業向けのパッケージかによって使い勝手は異なるためです。必要な機能をリストアップし、ベンダーからの提案内容が自社の方向性に合致しているか、カスタマイズが必要かを見極めます。明確な要件定義は、見積もりの請求や比較検討を効率化します。

機能とコストのバランスを考える

機能とコストを見る際は、「事務作業の代行」に重きを置きがちですが、「データ集計・加工時間の削減」という価値も含めて判断すると良いでしょう。

健康管理システムの選定において、機能とコストのバランスは重要です。まず、必要な機能を比較・検討し、優先順位付けを行います。特に「人的資本レポート作成支援」や「高度なクロス集計」などはオプションの場合が多く、価格に影響することがあります。自社の状況を鑑みて必須機能を整理しましょう。

次に、予算を設定します。単なるツール代としてではなく、人事担当者のタスクを効率化し、負担軽減させるための「投資」として捉えることが適切であるケースも多いです。Excelでの手作業集計ミスを防ぎ、従業員にとっても使いやすく、信頼できるデータを蓄積できるかという視点で、コストに見合った価値があるかを確認してください。

おすすめ健康管理システム8選（2026年版）

2026年の市場で評価の高い、実績豊富なシステムを厳選しました。

ハピネスパートナーズ（エムスリーヘルスデザイン株式会社）

健康経営に向けたトータルサポートを実現
医療DX業界大手のエムスリーグループが提供するシステムです。健診データの管理はもちろん、ストレスチェックの実施や集団分析など、心身の健康データを一元管理可能です。さらに、独自の健康指標「EBHS Life（エビスライフ）」を標準搭載している点が最大の特徴です。 健康診断の結果と生活習慣から「健康リスク」や「予測寿命」をAIが解析・スコア化できるため、人的資本経営で求められる「健康状態の客観的エビデンス」をこれ一つで可視化できます。プレゼンティーイズムやアブセンティーイズム、ワークエンゲージメントなど、健康経営におけるパフォーマンス指標も同時に算出できるため、健康経営度調査票の提出時にも効率化が可能です。また、紙やエクセルの管理から移行することで「87%の工数削減」を実現した実績もあり、戦略的な健康経営を目指す企業に選ばれています。

高いカスタマイズ性
一般的に、低コストなクラウド型システム（SaaS）は機能が固定されており、導入に際して「システムに合わせて社内の業務フローを変更する」という負担が発生しがちです。 しかし、ハピネスパートナーズは「クラウドの手軽さ（初期費用・保守の手間なし）」と「スクラッチ開発のような柔軟性」を両立している点が特徴です。「現場に負担をかけず、スムーズにシステム化したい」という企業に最適な選択肢です。

専門スタッフによる導入サポート
健康管理システム導入時の不安感を解消してくれるサポートが充実しています。最短3か月で導入可能で、導入後も専門スタッフが安定運用に向けたレクチャーの実施が可能です。導入～安定運用までの間に不安を感じている担当者にはおすすめのツールです。

サービスサイト：https://m3hd.co.jp/service/partner

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Carely（株式会社iCARE）

株式会社iCAREが提供するCarely（ケアリィ）は、人的資本データの活用を強力にバックアップします。人事労務担当者にとって簡単に操作できるUIに加え、システムがハイリスク者を自動抽出し、担当者へアラートを出す機能があります。カスタマーサクセスによるメールやチャットでのサポートも手厚く、シェアも拡大中のツールです。他社の成功事例をシェアするコミュニティもあり、企業が継続して健康経営に取り組める仕組みが整っています。
サービスサイト：https://www.carely.jp/

FiNC for BUSINESS（株式会社FiNC Technologies）

FiNC for BUSINESSは、従業員向けのスマホアプリが特徴的です。歩数や食事などのライフログと連携し、多様な健康コンテンツを提供することで、ユーザーの自発的な健康づくりを促します。法人向け機能としては、プレゼンティーズム等の分析機能が充実しており、企業は以下のカテゴリー（食事・運動・睡眠）ごとに課題を特定できます。最新のウェルビーイングトレンドを取り入れ、スムーズに施策を実行可能。従業員500名以上の企業でも受付やフォローの自動化が進んでおり、若手層への訴求力も高いと言えます。
サービスサイト：https://biz.finc.com/

Well-Gate（ヘルスケアテクノロジーズ株式会社）

ソフトバンクグループのヘルスケアテクノロジーズが提供するWell-Gateは、ヘルスケアアプリ「HELPO」との連携により、チャット医療相談など個人ごとの個別対応が可能です。多機能なプラットフォームでありながら、健康診断結果の管理も容易に行えるため、ユーザーは自分の健康状態をしっかりと把握できます。時間や場所を選ばず使いやすい設計で、従業員の属性に合う施策が用意されています。導入により高い業務効率化および健康経営優良法人の獲得などが期待できます。
サービスサイト：https://www.softbank.jp/biz/services/hr-tech/well-gate/

Growbase（ウェルネス・コミュニケーションズ株式会社）

Growbase（グロウベース）は、健診代行サービスとの連携が非常にスムーズな点が特徴です。アプリやツールを通じて、健診結果やストレスチェックデータを一元管理できます。ウォーキング等の健康イベント機能もあり、記事の掲載や情報の更新、データの共有が簡単です。無料デモやTOP画面の視認性の良さなど、基本機能が充実しており、アクセス権限管理も厳格です。ウェルネス・コミュニケーションズのネットワークを活かしたサポートも魅力です。
サービスサイト：https://hss.wellcoms.jp/

HealthCore（株式会社エムステージ）

HealthCoreは、産業医紹介事業大手の株式会社エムステージが提供するシステムです。運営会社の強みである医療機関との連携が強く、産業医や保健師など専門家によるサポートとシステムが一体化しています。利用者は信頼性の高い健康情報を得ることができ、データ分析も高度なため、企業は全体の健康リスクを可視化し、現場への介入を的確に行えます。大企業から中小規模の会社まで、100名〜数千名規模でメリットを発揮できます。これらの特徴から標準的かつ人気のあるツールです。
サービスサイト：https://healthcore.humanage.co.jp/

HM-neo（NTTテクノクロス株式会社）

HM-neoは、IT技術を活用した健康管理システムで、大規模組織特有の複雑な人事異動や組織図に対応できるカスタマイズ性が高い点が特徴です。一元管理された情報の表示設定も柔軟で、電話相談窓口との連携や、自動判定ロジックの追加など、人的リソースを補完する機能が充実しています。以上の点に加え、金融機関や官公庁でも採用されるレベルのセキュリティ対策が施されています。
サービスサイト：https://www.ntt-tx.co.jp/products/hm-neo/

Be Health（株式会社エヌ・エイ・シー・ケア）

株式会社エヌ・エイ・シー・ケアのBe Healthは、専門的な視点での管理が行えます。シンプルな操作性が魅力で、健康診断、ストレスチェック、保健指導などのデータを統合管理が可能です。また、紙の健診結果のデータ化などのBPOサービスも充実しており、保健師の業務負担を減らせます。全国に拠点を持つ企業全体の健康管理に最適です。
サービスサイト：https://www.behealth.jp/

健康管理システムの機能比較（2026年版）

データの活用しやすさや連携機能が、比較の際の新しい基準になりつつあります。

健康診断データの管理機能

健康診断データの管理機能においては、ユーザーが過去のデータと比較し、システムが将来のリスクを分析・可視化する機能も求められるようになっています。異常値を検出した際に内容に応じて自動で受診勧奨メールやアラートを送信する機能は、担当者にとって便利です。判定結果に基づくコラムのレコメンドや、労基署へのレポート作成機能も登録されているか確認しましょう。

ストレスチェックとメンタルヘルス機能

ストレスチェックについては、実施から集計、労基署への報告書作成までがワンストップで行えるかをチェックします。現在は「集団分析」の結果から、組織の状況改善提案までをシステムが自動で行う機能も増えています。メンタル不調の未然防止として、アンケート結果に基づいたメンタルヘルス教育動画の配信や、高ストレス者が産業医とスムーズに連携できる機能が有用です。社内イベントや運動施策と連動させ、負担なく参加できる仕組みも重要です。

オンライン面談機能の有無

リモートワークが定着した2026年において、オンライン面談機能は重要度を増しています。面談の予約がカレンダー連携などで簡単にできるか確認しましょう。ZoomやTeamsなどの外部ツールを使わずとも、システム内でビデオ通話ができるか、画面共有などの操作性を確認します。相談内容の記録管理において、プライバシー保護の対策（閲覧権限の制御など）についても触れ、ユーザーが安心してサイトを利用できる環境を提供することが重要です。

健康管理システムの導入メリット

システム導入は、事務効率化だけでなく、企業価値の向上に寄与する可能性があります。

人的資本情報の「エビデンス」として活用しやすい

投資家や求職者が企業を選ぶ際、「社員を大切にする会社か」という点を重視する傾向が強まっています。

• システムなし： 紙やExcelでの管理では、「高ストレス者の割合」や「健康施策による改善率」などを正確に把握するのに手間がかかる場合があります。
• システムあり： 健診結果やストレスチェック等のデータが集約されるため、人的資本レポートや統合報告書等に掲載するためのデータを比較的スムーズに出力できる可能性があります。

これにより、経済産業省が推進する人的資本経営の方向性に沿った開示を行いやすくなり、対外的な信頼度の向上につながることが期待されます。

業務効率の向上とDX推進

業務効率の向上については、健康管理システムがデータを一元管理し、アナログ業務（紙の転記や封入作業）の削減をどう実現するかが鍵です。2026年はシステムによる判定代行などの自動化が進み、生産性の向上に役立つ機能が増えています。産業医や経営層との迅速な情報共有が業務効率化に寄与し、企業の「医療DX」基盤となり得ます。最適なサービス選定は、人事部門の働き方改善に直結します。

従業員の健康意識とエンゲージメント向上

従業員の健康意識の向上に関しては、自身の健康状態がアプリ等で可視化されることで行動変容が起きる点がメリットです。人事や労務からの一方的な勧奨ではなく、ゲーミフィケーション要素を取り入れた目標設定や、保健指導機能によるフィードバックがエンゲージメントやモチベーションに好影響を与える可能性があります。 さらにエンゲージメントを高めるには、システムによる管理だけでなく、従業員がいつでも専門家に相談できる体制（EAPや医療相談サービスなど）を組み合わせるのがトレンドです。例えば、システムで不調を検知した後、「M3PSP（M3 Patient Support Program）」のような医療相談サービスへシームレスに連携することで、従業員の安心感を醸成し、離職防止や生産性向上に直結させることができます。

法令遵守の強化とリスクマネジメント

法令遵守の強化については、頻繁な法改正にシステムがいかに自動対応するかがポイントです。健診結果の保存義務はもちろん、時間外労働の上限規制対応など、法令に基づいた労務管理連携が重要です。リスク管理の向上や、監査対応がスムーズになる点にも触れ、一貫したデータ管理が企業のコンプライアンス維持・増進に不可欠であることを注目ポイントとして加え、おすすめします。

健康管理システムの導入における注意点

初期投資と運用コスト

初期投資と運用コストに関しては、導入にかかる費用だけでなく、ランニングコストと機能のバランスを見ます。2026年はSaaS型の価格改定も多いため、最新の料金表をもとに検討が必要です。過去データを蓄積・取り込みする作業費や、紙管理コストの削減効果を試算し、一元管理による大幅な業務効率化で元が取れるかを判断します。導入事例の費用対効果を参考に、安さだけでなく、一元化によるメリットが大きいプランを選びましょう。

従業員の理解と協力

システム導入時は、「管理強化」ではなく「従業員のウェルビーイング支援」が目的であることを社内に伝えます。従業員や社員にとってメリットがある（健診予約が楽になる、相談しやすくなる等）ことを周知し、取り組みへの協力を促します。また、操作説明会や専門家による活用指導を受けられる機会を設け、離職防止や組織への貢献意欲向上に合った運用体制を整えます。

データセキュリティの確保

データセキュリティは最重要課題です。機微な個人情報を扱うため、厳格なアクセス権限の設定やログ管理が必要です。資料のダウンロード制限、データ分析時の匿名化措置など、システム側の対策を確認します。また、予約システムやサーベイ回答時の通信暗号化など、安心して利用できる基盤があるか確認し、定期的な脆弱性診断を行っているベンダーを選びましょう。

クラウド型とオンプレミス型の比較

クラウド型のメリットとデメリット

クラウド型の利点は、常に最新の法改正対応や機能アップデートが月額費用内で受けられる点です。見える化されたダッシュボードにどこからでもアクセスでき、リモートワークにも対応します。ランキング上位の優良システムの多くはクラウド型で、多様・多彩なAPI連携が可能です。デメリットとしてはネット環境への依存がありますが、これらをまとめて、それぞれの効果とリスクを比較検討してください。

オンプレミス型のメリットとデメリット

オンプレミス型は、大規模企業や特殊なセキュリティ要件を持つ官公庁などで推奨される場合があります。特徴として、自社ネットワーク内でデータを集約・管理できるため、外部接続リスクを遮断できます。独自の評価制度や特殊な業務フローに合わせた深いカスタマイズが強みですが、オプション追加や法改正対応に追加コストがかかる場合があります。クラウドとは異なり、個別の要件定義が必要なため、専門家からのアドバイスが重要です。

健康管理システムの導入ステップ

要件定義と目的の明確化

導入の第一歩は、目的の明確化です。「健康経営銘柄を取得したい」「人的資本レポートを充実させたい」など、具体的なゴールを設定します。産業医の意見や、現場の課題（受診率の低さ等）を反映し、必要な機能をリスト化しましょう。これにより、要件定義がブレず、後の選定や運用がスムーズになります。詳細なデータの取得や、コンプライアンスの徹底、問題解決が実現し、充実した体制構築に繋がります。

システム選定とデモ検証

Web検索や選び方の記事を参考に候補を抽出し、3〜4社のシステムを比較します。できる限りデモ版を利用し、人事だけでなく従業員目線での使いやすさを確認してください。実績豊富なベンダーを選び、導入スケジュールやサポート体制も含めて判定します。最適なシステムを選ぶことが、長期的な運用の成功の鍵です。

運用体制の構築

導入後の混乱を防ぐため、運用ルール（入力期限、閲覧権限等）を策定します。部署横断的な体制・組織を作り、活用を推進する担当者を決めます。柔軟な運用ができるよう、利用規約や搭載機能の変更に備え、定期的に運用を見直すサイクルを構築しましょう。他システムの統合やAPI連携も視野に入れた構成を検討します。

まとめと今後の展望

健康管理システムの重要性

健康管理システムは、今や経営のインフラとなりつつあります。健康管理システムによるデータ活用は、従業員の疾病予防や勤怠改善だけでなく、企業の社会的評価や投資家へのアピールにも繋がる重要な要素です。実際のデータに基づいた評価・意思決定が可能になることで、労働環境の改善や制度変更がより精緻に行えます。関連する人的資本経営の文脈でも、有効なツールの一つと言えるでしょう。

今後の健康経営のトレンド（2026年〜）

2026年以降、健康経営は「守りの管理」から「攻めの投資」へシフトしていくと考えられます。2025年に普及したデータ活用技術がさらに進化し、早期発見や予測、個々人に最適化された戦略的なアドバイスが自動化される可能性があります。産業医や産業保健スタッフは、より高度な判断やケアに集中できるようになるでしょう。長時間労働是正などの法対応に加え、働き方の柔軟性を高め、従業員の幸福度を追求することが企業の生存経営戦略となっていきます。報告書作成などの事務作業はシステムに任せ、人は「対話」と「変化」に注力する時代になるでしょう。

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